奥密克戎新变异株BA.2.12.1占据美国半壁江山

发布日期:2022-05-22 07:55:59

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  当地时间5月20日,美国疾控中心(CDC)发布░新冠疫情周报,拥¯有超强免疫逃逸能力的奥密克戎新变异株BA.2.12.1已占据美国新增病例的47.5%。而在2ⓒ个月前,BA.2.12.1的比例为1.5%,60天内占比提升了30倍。

  美国去ત年冬天到今年春天刚刚经历了奥密克戎疫情海啸,前半程是BA.1,后半程是BA.2。然而大量人Þ口的感染外加疫苗接种带来的人群高免疫水平还是挡不住BA&#222e;.2.12.1再掀波澜。因为BA.2.12.1刺突蛋白的突变令其具有超强的免疫逃逸能力。

  BA.2.12.1刺突蛋白L452位点的突变是奥密克戎BA.1、BA.2子变体所没有、而德尔塔变异株所拥有的刺突蛋白突变位点。这意味着奥密克戎变异株在强大的正向选择压力下,在刺突蛋白基因上出现了与德尔À塔毒株的趋同进化。刺突蛋白上的变异之所以尤其值得关注,因为刺突蛋白在新冠病毒进入人类细胞中起到了关键作用:♩刺突蛋白能结合人类细胞的ACE2受体,跨过细胞膜侵入,是打开细胞大门的“▦钥匙”,也是mRNA疫苗和抗体药物设计的主要靶标。

  BA.2.12.1具有强大的免疫逃逸能力。美国俄亥俄大学最新的研究显示,用BA.1、BA.2感染后康复人群的血清和接 种2针或3针mRNA疫苗人群血清中的中和抗体做测试,发现相比奥密克戎传播最广的子变体BA.1、BA૪.2, BA.2.12.1具有更强的抗&#25d3;性。除了免疫逃逸能力外,研究显示BA.2.12.1的刺突蛋白还具有更强的传染性、处理能力和细胞融合。

  在BA.2.12.1的推动ਯ下,美国新冠病例正在猛增。ડ根据CDC的周报,美国日新增病例较一周前上升了1◊8.8%,核酸阳性检出率上升了23.2%,日新增入院人数上升了24.2%。

  具体来说,截至2022年5月18日,当前每日新增病例的7天移动平均值为10.11万例,之前的7天移动平均值为日增8.੏51万例,截&#25a1;至2022年5月18日,美国共报告了82820565例新冠病例。核酸阳性检出率为10.6%,Í一周前这一数字为8.6%。每日新增入院患者的7天移动平均值为3250人,一周前这一数字为2629人。

  根据美国疾控中心CDC最新的监测数据,BA.2.12.1变异株已经占据了纽约州、新泽西州73.1%的比例。而在全美,BA.2.12ρ.1变异株也已经占据了的比例,这较一周前的42.6%飙升了11.5%。目જ前还没有证据表明BA.2.12.1会导致比原始奥密克戎毒株其各种子变异体更为严重的&#25b3;症状。

  此前外界普遍认为的奥密克戎毒力较弱,然而近期来自港大、哈佛大学两个团队的研É究均显示,在未接种疫苗的情况下,感染奥密φ克戎毒株面临着与感染早期新冠原始毒株相似的死亡风险。∫

  延伸☼阅读:BA.2.12.1刺突蛋白上的L452Q੕突变

  根据进化树分析,BA.2.ૢ12.1的出现时间应该是ક2021年末到2022年初,出现地点大概率是美国,截至4月全球上传的BA.2.12.1੉序列97%来自美国。

  要理解BA.2ⓨ.12.1出现L452Q意味着什么,首⊆先得了解刺突ⓑ蛋白。

  刺突蛋白,是新冠病毒与人体细胞é受体结合并进入宿主细胞的重要结构。由于刺突蛋白也是中和抗体和T细胞针对的对象,因此刺突蛋白受到的正向▨选择压力格外大,变异频繁。

  刺突蛋白共有1273个氨基酸位点,由相对中间的681位点将其分为S1和⌊S2两个亚基。S1亚基由N端结构域和受体结构域(receptor-binding domain, RBD)构成,S2亚基由融合肽(FP)、内部融合肽(IFP)及૦两个七肽重复区੭组成。

  新冠病毒颗粒通过刺突蛋白的S1亚基RBD结构域与ACE2受体结合后锚定在人体细胞上。细胞上的跨膜丝氨酸蛋白酶2(transmembrane protease serine 2ρ,TMPRSS2)能够激活新冠病毒入侵细胞。在TMPRSS2作用下S1亚基被切割,暴露出S2亚基中的FP,启动膜融合并进一步将病毒释放到宿主ε细胞中。随后病毒ssRNA附着在核糖体上进行复制和蛋白的翻á译并进一步的加工包装成新的病毒,在释放后造成感染的扩散与宿主细胞的损伤并激活免疫系统。

  考虑到☎受体结构域(RBD,319至537之间)是刺突蛋¿白与ACE2受体结合的区域,这部分的突变可能影响免疫逃逸能力和受体≡亲和能力,因此这部分的突变格外受到病毒学家的关注。452位点便位于受体结构域(RBD)。

  如果说452指的઴是刺突蛋સ白的位置,那么两个字母L和Q指的是相应的氨基酸。蛋白质由20种氨基酸构成,其中L指的是突变前的氨基酸是亮氨酸,R代表了突变后的氨基酸类型是ⓓ谷氨酰胺。L452Q的完整意思就是刺突蛋白位点452的亮氨酸突变成了谷氨酰胺。

  奥密克戎席卷全球的浪潮可分为两部分:BA.1主导前期,之后BA.2迅速取代前者。病毒学家Stegger等人的研究发现BA.2能够重新感染新近从BA.1感染中康复的患者,因为B¡A.2拥有几个关键突变,使其有别于BA.1谱系,包括T191、L24S、A25/27、V213G、T37&#ffe0 ;6A和R408S。而这些关键突变使得全球新冠感染者ℜ飙升。

  而近期,BફA.2谱系下BA.2.12.1则正在续写BA.2取代BA.1的੠剧本。BA.2.12.ࢵ1是Pango命名法下的名称。Pango命名前面的英文字母代表属于某一个支系,后面的点和数字代表来源于前面支系的第几个子代分支。BA.2.12.1意味着其为奥密克戎谱系第2分支下的第12个子分支下的第1个孙分支。

  BA.੝2.12.1相比其祖先B◙A.2的最大不同在于L452Q突变。值得注意的是,L452位点的突变是上一个被世卫组织定义为“关切变异株(VÏOC)”德尔塔变异株所拥有,而奥密克戎BA.1、BA.2所不具备的。

  北大谢晓亮团队的研究显示,BA.2.12.1相对于BA.1具有更强的受体亲和力。与BA.2相૪比Ÿ,BA.2.12.1对已接种三针疫苗的受试者血清表¼现出了更强的中和抗体逃逸能力。

  谢晓¨亮团队还筛ξ选出了共1640种受体结构域中和抗体,其中614种是从BA.1康复者血清中分离的抗体。研究者测试了它们针对奥密克∨戎各变异株的中和能力。

  论文表示,疫苗接种+BA.1感染史主Ê要激活原始株诱导的体液免疫记忆,并主要产生对原始株和BA.1有交叉免疫保护的中和抗体。这些具有交叉免疫保护的中和抗体很容易被刺突蛋白L452位点的突变所逃逸,比如拥有L452Q 突变的BA.2.12.1,以及拥有L452M突变的BA.2.13和∗拥有L452RΒ突变的BA.4/BA.5等。

  这也解释了L4δ52位点的突变在奥密੠克戎各亚谱系子变体中频繁出现,其实为了应对B஻A.1感染康复者的免疫压力。

  俄亥俄大学团队的研究则选取了接种过2剂、3剂m&#263d;RNA疫苗的医护工作者的血清,测试了BA.2.12.1与BA.1和υBA2病毒的免疫逃逸能力,结果发现BA.2.12.1⌈具有更强的中和抗体抗性,逃逸能力更强。

  具体来说,接种2剂疫苗的医护工作者血清对BA.1、BA.2的中和抗体滴度相比原始毒株下降了20倍,而对BA.2.1Ņ2ટ.1的中和抗体滴度相比原始毒株更是下ⓚ降了36倍。

  接种3剂疫苗的医护工作者血清对BA.2的中和抗体滴度相比Ä原始毒株下降了2.9倍,>而对BA.2.12.1的中和抗体滴度相比原始毒株更Þ是下降了3.7倍。

  更强的免疫逃逸能力,意味着Ô接੨种了…疫苗或者之前感染了奥密克戎BA.1、BA.2毒株之后,仍有可能再次被BA.2.12.1感染。

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